A partir del año 2004 la Universidad Autónoma del Estado de México (UAEM) cuenta con el Sistema de Gestión de la Calidad (SGC) certificado con las diferentes versiones de la Norma ISO 9000, el cual ha contribuido al reconocimiento de una Universidad con calidad en la educación.
La Dirección de Organización y Desarrollo Administrativo a través del Departamento del Sistema de Gestión de la Calidad con base en la Norma ISO 9001:2015, coordina las acciones referentes a la operación, mantenimiento y mejora continua de los procesos que integran el SGC de la UAEM, así mismo, con el objetivo de mantener la certificación del SGC, brinda asesoría personalizada, capacitación y seguimiento a todo el personal que participa en el Sistema de Gestión de la Calidad, cuyos procesos que la integran atienden las necesidades y expectativas de la comunidad universitaria y de la sociedad en general.